Większość zmian wprowadzonych w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych dotyczy zwolnień podatkowych uregulowanych w art. 21 tejże ustawy.
Nowe brzmienie otrzymał art. 21 ust. 1 pkt 15 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, zgodnie z którym zwolnione z podatku dochodowego od osób fizycznych są świadczenia osób otrzymywane z tytułu odbywania lub pełnienia:
1) niezawodowej służby wojskowej lub jej form równorzędnych, z wyjątkiem okresowej służby wojskowej, nadterminowej zasadniczej służby wojskowej oraz służby przygotowawczej,
2) służby zastępczej.
Zmiana ta jest rezultatem nowelizacji ustawy o powszechnym obowiązku obrony Rzeczpospolitej Polskiej.
Następne zmiany wprowadzone w przepisach art. 21 ustawy w podatku dochodowym od osób fizycznych związane są z powołaniem do życia na mocy ustawy z 27 sierpnia 2009 r. o finansach publicznych agencji wykonawczych. Jest to państwowa osoba prawna powołana w celu realizacji zadań państwowych w zakresie zarządzania programami wspólnotowymi. Od 01.01.2012 r. agencjami wykonawczymi będą Agencja Nieruchomości Rolnych, Agencja Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa, Wojskowa Agencja Mieszkaniowa, Agencja Mienia Wojskowego, Agencja Rezerw Materiałowych, Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości, Agencja Rynku Rolnego, Narodowe Centrum Badań i Rozwoju.
W związku z powyższym nowe brzmienie otrzymał art. 21 ust. 1 pkt 46 lit. a ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, zgodnie z którym zwalnia się z podatku dochodowego od osób fizycznych dochody otrzymane przez podatnika, jeżeli pochodzą od rządów państw obcych, organizacji międzynarodowych lub międzynarodowych instytucji finansowych ze środków pomocy, w tym ze środków programów ramowych badań, rozwoju technicznego i prezentacji Unii Europejskiej i z programów NATO, przyznanych na podstawie jednostronnej deklaracji lub umów zawartych z tymi państwami, organizacjami lub instytucjami także przez agencje wykonawcze. W związku z tą zmianą ze zwolnienia, korzystać będą również dochody podatników, którzy realizują zadania na podstawie umów, których stroną jest agencja wykonawcza. Tak jak dotychczas aby skorzystać ze zwolnienia, podatnik musi spełniać również warunek określony w art. 21 ust. 1 pkt. 46 lit. b ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, mianowicie bezpośrednio realizować cele programu finansowanego z bezzwrotnej pomocy.
Konsekwencją utworzenia agencji wykonawczych są kolejne zwolnienia wprowadzone w przepisach art. 21 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych:
- w pkt 47c, na mocy którego obok kwot otrzymanych od agencji rządowych wolne od podatku będą również kwoty otrzymane od agencji wykonawczych, jeśli agencje te otrzymały środki na ten cel z budżetu państwa;
- w pkt 47d, zgodnie z którym również dotacje, subwencje, dopłaty i inne nieodpłatne świadczenia lub świadczenia częściowo odpłatne, otrzymane na cele związane z działalnością rolniczą z budżetu państwa, m.in. od agencji wykonawczych, będą korzystały ze zwolnienia podatkowego;
- w pkt 114, na podstawie którego zwolniona będzie wartość otrzymanych nieodpłatnych świadczeń lub świadczeń częściowo odpłatnych oraz wartość świadczeń rzeczowych (w naturze) finansowanych lub współfinansowanych ze środków, agencji wykonawczych w ramach rządowych programów.
Ponadto w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych pojawiły się nowe zwolnienia podatkowe. Do art. 21 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych dodano:
- pkt 136 obejmujący zwolnieniem płatności na realizację projektów w ramach programów finansowanych z udziałem środków europejskich, otrzymane z Banku Gospodarstwa Krajowego, z wyłączeniem płatności otrzymanych przez wykonawców;
- oraz pkt 137 zwalniający od podatku środki finansowe otrzymane przez uczestnika projektu jako pomoc udzielona w ramach programu finansowanego z udziałem środków europejskich, o których mowa w ustawie z dnia 27 sierpnia 2009 r. o finansach publicznych (Dz. U. Nr 157, poz. 1240).
Wydatki i koszty bezpośrednio sfinansowane z dochodów (przychodów), o których mowa w w/w art. 21 ust. 1 pkt 136 i pkt 137 nie będą uznawane za koszty uzyskania przychodów, zgodnie ze znowelizowanym brzmieniem przepisu art. 23 ust. 1 pkt 56 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych
W związku z uchwaleniem ustawy z 19 listopada 2009 r. o grach hazardowych, dostosowano brzmienie art. 21 ust. 1 pkt 6a ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych do zmienionej nazwy ustawy.
Skala podatku dochodowego od osób fizycznych oraz pracownicze koszty uzyskania przychodu w 2010 roku pozostają bez zmian.